MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 1

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008503	GCAA	2	8	80	87	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008503	AATAAA	2	12	169	180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008503	ATTT	2	8	226	233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008503	TCA	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008503	CTT	2	6	387	392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008503	TAA	2	6	3967	3972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008503	TTA	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008503	AATA	2	8	3997	4004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008503	A	7	7	4004	4010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008503	A	6	6	4013	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008503	TTG	2	6	4019	4024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008503	AGAA	2	8	4032	4039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008503	TTTTTA	2	12	4043	4054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008503	GCA	2	6	4072	4077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008503	AAT	2	6	4110	4115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008503	ATTG	2	8	4125	4132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008503	A	6	6	4133	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008503	ATG	2	6	4174	4179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008503	TAT	2	6	4182	4187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008503	GTTA	2	8	4188	4195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008503	GTT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008503	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008503	A	6	6	4335	4340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008503	TAC	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008503	A	6	6	4395	4400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008503	T	6	6	4422	4427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008503	ACTA	2	8	4464	4471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008503	TGA	2	6	4545	4550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008503	CTA	2	6	4623	4628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008503	AAT	2	6	4642	4647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008503	AGG	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008503	TTTA	2	8	5383	5390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008503	CTT	2	6	5408	5413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008503	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008503	ATA	2	6	5450	5455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008503	T	6	6	5457	5462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008503	ATC	2	6	5535	5540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008503	TAT	2	6	5567	5572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008503	GGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008503	ATAA	2	8	5586	5593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008503	T	6	6	5615	5620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008503	ATTT	2	8	5669	5676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008503	T	7	7	5696	5702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008503	T	8	8	5787	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008503	TATT	2	8	5855	5862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008503	CCT	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008503	TAA	2	6	5871	5876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008503	TCT	2	6	5903	5908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008503	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008503	TAT	2	6	7726	7731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008503	TA	3	6	7750	7755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008503	T	6	6	7757	7762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008503	TA	3	6	7768	7773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008503	T	6	6	7779	7784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008503	TA	3	6	7790	7795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008503	T	6	6	7801	7806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008503	TA	3	6	7812	7817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008503	T	6	6	7823	7828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008503	T	8	8	7868	7875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008503	AT	4	8	7900	7907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008503	T	7	7	7931	7937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008503	T	7	7	7939	7945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008503	GTCAAA	2	12	7965	7976	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008503	CAAA	2	8	8053	8060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008503	GAC	2	6	8109	8114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008503	ATT	2	6	8214	8219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008503	TTC	2	6	8230	8235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008503	TTAT	2	8	8276	8283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008503	GT	3	6	8314	8319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008503	CTA	2	6	8350	8355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008503	AAT	2	6	8369	8374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008503	AGG	2	6	8388	8393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008503	TTTA	2	8	9110	9117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008503	TAG	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008503	AAC	2	6	9170	9175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008503	ATT	2	6	9197	9202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008503	AAT	2	6	9223	9228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008503	TAT	2	6	9237	9242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008503	A	6	6	9251	9256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008503	TAAAA	2	10	9266	9275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008503	TAG	2	6	9377	9382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008503	AAT	2	6	9471	9476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008503	A	6	6	9482	9487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008503	T	6	6	9493	9498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008503	TCTCC	2	10	9541	9550	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_008503	TAGT	2	8	9594	9601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008503	TAA	2	6	9602	9607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008503	A	7	7	9606	9612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008503	ATTACT	2	12	9635	9646	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008503	A	6	6	9665	9670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008503	GCTAT	2	10	9678	9687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008503	A	7	7	9707	9713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008503	GAG	2	6	9718	9723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008503	T	7	7	10057	10063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008503	T	6	6	10173	10178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008503	AAT	2	6	10185	10190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008503	TAAT	2	8	10194	10201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008503	A	6	6	10241	10246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008503	TTTG	2	8	10252	10259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008503	T	6	6	10534	10539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008503	TAT	2	6	10556	10561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008503	CCT	2	6	11495	11500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008503	ATAA	2	8	11517	11524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008503	TAAAA	2	10	11541	11550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008503	GTCA	2	8	11820	11827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008503	A	7	7	11897	11903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008503	A	6	6	11934	11939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008503	A	7	7	11943	11949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008503	CTT	2	6	11955	11960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008503	A	6	6	11968	11973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008503	AGG	2	6	12089	12094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008503	TAT	2	6	12109	12114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008503	AAAGC	2	10	12182	12191	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008503	A	7	7	12257	12263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008503	T	6	6	12339	12344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008503	TTC	2	6	12390	12395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008503	T	6	6	12453	12458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008503	TC	3	6	12508	12513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008503	ATT	2	6	12594	12599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008503	ATA	2	6	12601	12606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008503	TGA	2	6	12628	12633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008503	TTGA	2	8	13740	13747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008503	TTA	2	6	13771	13776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008503	TGC	2	6	13782	13787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008503	CCA	2	6	13835	13840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008503	CTT	2	6	13857	13862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008503	TTTG	2	8	13949	13956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008503	GTT	2	6	13973	13978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008503	TTG	2	6	13984	13989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.